Saber está ansioso por ir al templo, pero Shirō ha insistido en que no irán porque parece demasiado peligroso. Sin embargo, tan pronto como Shirō se duerma, Saber se dirige sola al templo, no solo para ser confrontada por el sirviente identificado como Assassin. A diferencia de cualquier otro servidor, Assassin en realidad revela su verdadera identidad a Saber, como Sasaki Kojirou. Aunque la conversación termina aquí y la lucha comienza, pero mientras esto sucede, Rider se les escapa y entra al templo para luchar contra una mujer. ¿Quién es esta misteriosa mujer y Shinji estaba planeando esto todo el tiempo?

Shirō Emiya perdió a su familia hace diez años en un enorme incendio que consumió gran parte de la ciudad de Shinto. Atrapado entre las llamas, se da por vencido y acepta su propia muerte, pero un enigmático hombre lo encuentra y lo ayuda. Este hombre, Kiritsugu Emiya, adopta a Shirō, y le revela su identidad como mago. Kiritsugu también le cuenta a Shirō su fallido intento en ser un "Héroe de la Justicia", un guardián de la humanidad que podría salvar cualquier vida. Por petición de Shirō, Kiritsugu intenta enseñarle magia, pero descubre que Shirō no tiene talento ni para la mayoría de hechizos fundamentales, por eso, después de la muerte de Kiritsugu, Shirō se encuentra terriblemente frustrado, sintiéndose incapaz de cumplir los designios de su padre con la justicia.