La nueva familia de Kōta crece mas ya que Nana comienza a vivir con ellos oficialmente. Despues se revela el pasado de Kurama y el por que quiso formar parte de los laboratorios de investigación diclonius. Posteriormente nace su primera hija, Mariko quien descubre que es una silpelit y enfrenta la difícil decision de matarla, en ello su esposa le ruega que la deje vivir y muere desangrada después del parto.

La historia comienza con una joven, llamada Lucy, escapando de unas instalaciones de investigación en una isla cercana a la costa de Kamakura en la prefectura de Kanagawa, Japón. Desarmada y desnuda, a excepción de un casco de metal que oculta sus rasgos, consigue salir del recinto tras desmembrar y asesinar a varios guardias y empleados utilizando una especie de poderes sobrenaturales. Momentos antes de escapar, un francotirador le dispara a la cabeza con un fusil de calibre .50, provocándole una herida leve al partir el casco y descubriendo dos protuberancias óseas, como pequeños cuernos, saliendo de su cabeza; tras esto, la joven cae inconsciente por un acantilado al mar.